Histórico (IBGE)
O município teve sua origem em um núcleo de pescadores que se organizaram em torno do movimentado porto de embarcações, situado no Oceano Atlântico. Ao terminar o corte do pau-brasil, em meados do século XVIII, ficou sendo lugar de veraneio das famílias Albuquerque Maranhão e de fazendeiros das redondezas. Seus moradores construíram a capela de Nossa Senhora da Conceição. As lavouras de cereais e a pesca de albacoras, capturadas na técnica do corso, passaram a ser os maiores recursos econômicos. O acontecimento mais notável na memória local foi a matança de agosto de 1877, em que João de Albuquerque Maranhão Cunhaú, senhor de engenho Estrela, latifundiário poderoso, à frente de um grupo armado veio à Baía Formosa para desalojar seus moradores, alegando a posse da enseada. O pescador Francisco Magalhães e mais quatorze homens armados com facas e cacetes enfrentaram os agressores, havendo luta furiosa em que perderam a vida seis pessoas. Houve processo e prisão do mandante e participante da chacina, que submetido a júri em Carguaretama, foi absolvido em 1878. A denominação Baía Formosa originou-se por situar-se na enseada que se constitui a única baía do estado do Rio Grande do Norte.
Fonte do histórico:
CASCUDO, Luís da Câmara. Nomes da terra: história, geografia e toponímia do Rio Grande do Norte. Natal: Fundação José Augusto, 1968. p. 163-164.
Formação administrativa:
Distrito criado com a denominação de Baía Formosa (ex-povoado), pela Lei Estadual n.º 958, de 30-11-1953, com terras desmembrada do distrito de Vila Flor, subordinado ao município de Canguaretama. Em divisão territorial datada de 1-VII-1955, o distrito de Baía Formosa figura no município de Canguaretama. Elevado à categoria de município com a denominação de Baía Formosa, pela Lei Estadual n.º 2.338, de 31-12-1958, desmembrado Canguaretama. Sede no antigo distrito de Baia Formosa. Constituído do distrito sede. Instalado em 17-01-1959. Em divisão territorial datada de 1-VII-1960, o município é constituído do distrito sede. Assim permanecendo em divisão territorial datada de 2018.